上海交通大学附属第一人民医院中医科创建于1956年。经过40多年的发展，科室规模不断扩大、完善，现已逐步形成了拥有内、外、妇、儿、针灸、推拿等二级学科，设有独立病房和中医教研室、实验室的医、教、研功能具全的中医临床科室。经全科人员共同努力，2000年被上海市卫生局确定为上海市综合性医院示范中医科。
  
  　　 中医科重视发扬中医特色、不断拓展业务，多年来先后开设慢性胃炎、风湿病、消化道肿瘤、病毒性心肌炎、慢性肾炎、糖尿病、小儿性早熟、妇科不孕症、乳腺病、肛肠病、痛风、伤口迟愈、慢支和哮喘、肥胖等近20个特色专病专科门诊。其中慢性胃炎专科成立已近30年，由全国名老中医张镜人教授担任顾问，专科诊治各种慢性胃炎，主攻中医药治疗萎缩性胃炎（或伴肠化）、胃癌前期病变。1997年经市卫生局验收通过，成立“上海市中医(中西医结合)慢性胃炎医疗协作中心”，2001年又被市卫生局批准为“上海市中医慢性胃炎特色专科”，专科建设在不断向纵深发展；中医妇科，由全国名老中医蔡小荪教授领衔，以流传百年、斐声国内外的“蔡氏妇科”为学术渊源，辨症准，用药精，见效速是其特点。尤其对不孕症、子宫内膜异位症的诊断和治疗有独到之处，颇具名望；风湿病专科，应用现代免疫学技术进行诊断，科学地应用中西医结合治疗各类风湿疾病疗效显著；消化道肿瘤专科运用化疗和中药相结合，可以有效提高患者生存质量，延长生存期；慢性肾炎专科，用中西两法综合治疗，对慢性肾功能不全有较好的疗效；针灸科治疗哮喘、肥胖症，推拿科治疗颈椎病等均各具特色；中医外科采用中药内服与外敷相结合、药物及传统手术相结合治疗肛肠疾病、乳腺疾病、以及伤口迟愈疗效显著。中医科现有专科特色院内自制制剂10余种，服用方便，疗效满意。由于中医科认真贯彻落实《中医药条例》，实施中医现代化的目标，具有鲜明的中医特色和确切的临床疗效，吸引了众多的患者就医，年门诊量达10余万人次。