2000年，武警医院成功实施乐山首例同种异体肾移植手术，拯救了一名尿毒症患者的生命；２００４年，医院又成功实施乐山首例、川西南地市级医院首例肝移植手术，使一名肝硬化晚期患者重获新生，而且在回访后了解到患者身体状况至今良好。
  
   大器官移植需要综合实力的保障，该院成功开展多例器官移植都得益于技术平台的不断扩展。
  
   医院的壮大和发展，离不开新业务和新技术的支撑。近年来，武警四川总队医院在不断更新医疗设备，培养引进人才的同时，把开展新业务新技术作为科技建院的“助推器”，使医院的技术水平始终在驻地处于领先水平。
  
   为了实现操作者与高精尖设备的有机结合，充分发挥人才设备优势，医院先后派出多批技术骨干下广东、飞上海、进北京，取经寻技、拜师学艺。与此同时，鼓励医护人员积极报考硕士、博士研究生，定期将医护人员送到军地知名院校学习进修，组织医学理论和专业技术研讨。在技术薄弱环节，医院先后与北京协和医院、华西医科大学附属医院等建立了医疗协作关系，进行互补和帮带。同时，医院积极建立起一体化的信息系统，用信息高速公路构建医院快速反应的绿色通道，开通了远程医疗会诊，加入了全军医学互联网，使军内外大医院的技术优势，变为本院的技术优势。
  
   另外，该院成立了科研委员会，建立科研奖励基金，重奖科研有功人员，以鼓励医务人员结合临床搞科研，积极撰写学术论文，开展新业务新技术。据统计，医院现有科研成果３２项。其中，获武警部队科技进步奖二等奖１项、三等奖３１项。
  
   近年来，通过开展新业务新技术，提升了医院专业学科的发展。医院肝胆、烧伤整形、微创外科、创伤急救、泌尿外科、耳鼻喉科、心肾内科专业在军内外独树一帜；准分子中心、妇科中心、健康体检中心、肿瘤中心在驻地颇有影响；腹腔镜胆道手术３万例，居省内之冠；电视胸腔镜，椎间盘镜诊治技术居省内领先水平；大面积烧伤救治、鼻内窥镜诊治技术在同级医院中技术领先。如今医院建设已驶入快车道，拥有床位８６０张，年门诊量２０万人次，年收容量１．５万人次，手术６０００余台次。